哥伦比亚国家博物馆设有四个主要展室,分别展出征服时期、殖民时期、独立时期和共和国时期的历史文物。
博物馆藏有超过20000件藏品,包括代表国家不同历史时期的艺术作品和物件。常设展览呈现了哥伦比亚考古学和人种学文物样品,上溯至公元前10000多年,一直到二十世纪的土著和非洲裔哥伦比亚人的艺术和文化。缔造者和格拉纳达新王国时期展室藏有解放者和其他西班牙人肖像;圆形展室的展品来自哥伦比亚绘画史上的一系列著名作品。绘画大师黛博拉·阿朗戈,费尔南多·波特罗,恩里克·格劳,伊格纳西奥·戈麦斯·哈拉米略,圣地亚哥·马丁内斯德尔加多,亚历杭德罗·奥布雷贡,奥马尔·拉约,安德烈斯·圣玛丽亚,吉列尔莫·威德曼的作品是常设展览的一部分。 2006年6月15日至9月17日,中国秦陵兵马俑展览在哥伦比亚国家博物馆举办。在为时95天的展期内,该展以其高质量的文化品位和内涵吸引了哥全国各地20万观众前来观看,从而在观众人数上打破了哥国家博物馆自建馆以来的历史记录。