该岛北部是丘陵地带，南部地形平坦。年平均温度为28℃（82℉）。年雨量不到500公釐（20吋）。全岛位于加勒比飓风带的范围以外。
博内尔岛是一个形状酷似手枪的小岛，过去的40年来，这个小岛在保护珊瑚礁方面显示出令人惊讶的智慧。自从1961年以来，岛上的海龟蛋和巢穴就得到了保护。十年后，用鱼叉捕鱼被明令禁止。1975年，收集珊瑚礁成为非法的行为。1979年，环绕博内尔岛的整体珊瑚礁被宣布为海底公园，从此，这里的每一只海绵、鲨鱼或是海马都得到了彻底的保护。这个岛屿也因此而赢得了世界各地自然资源保护主义者的高度评价。人们普遍认为，这里是加勒比海区域最好的潜水和浮潜的目的地，堪称“潜水者的天堂。” 
