α-螺旋(蛋白质的二级结构)
蛋白质中常见的一种二级结构,肽链主链绕假想的中心轴盘绕成螺旋状,一般都是右手螺旋结构,螺旋是靠链内氢键维持的。每个氨基酸残基(第n个)的酰基氮与多肽链C端方向的第4个残基(第n+4个)的羰基碳形成氢键。在典型的右手α-螺旋结构中,螺距为0.54nm,每一圈含有3.6个氨基酸残基,每个残基沿着螺旋的长轴上升0.15nm。螺旋的半径为0.23nm。 类型 | 蛋白质的二级结构 |
螺距 | 0.54nm |
螺旋的半径 | 0.23nm |
α-螺旋
①肽链以螺旋状盘卷前进,每圈螺旋由3.6个氨基酸构成,螺圈间距(螺距)为5.44埃;②螺旋结构被规则排布的氢键所稳定,氢键排布的方式是:每个氨基酸残基的N—H与其氨基侧相间三个氨基酸残基 的形成氢键。这样构成的由一个氢键闭合的环,包含13个原子。因此,α-螺旋常被准确地表示为螺旋。螺旋的盘绕方式一般有右手旋转和左手旋转,在蛋白质分子中实际存在的是右手螺旋。①侧链基团的电荷性质和大小都有影响,甘氨酸由于侧链太小,构象不稳定,是α螺旋的破坏者;② 连续存在带相同电荷的氨基酸残基;③ 不存在脯氨酸残基,脯氨酸由于其亚氨基少一个氢原子,无法形成氢键,而且键不能旋转,所以是α螺旋的破坏者,肽链中出现脯氨酸就中断α螺旋,形成一个“结节”。 螺旋中所有氢键都沿螺旋轴指向同一方向。每一肽键都有由和的极性产生的偶极距。 所谓帽化就是给末端裸露的和提供仅见氢键配偶体(partner),并折叠蛋白质的其他部分以促成与末端的非极性残基的疏水作用。