TRIzol(新型总RNA抽提试剂)
TRIZOL是一种新型总RNA抽提试剂,可以直接从细胞或组织中提取总RNA。其含有苯酚、异硫氰酸胍等物质,能迅速破碎细胞并抑制细胞释放出的核酸酶。TRIZOL的主要成分是苯酚。TRIZOL在破碎和溶解细胞时能保持RNA的完整性,因此对纯化RNA及标准化RNA的生产十分有用。
TRIZOL试剂
TRIZOL
生化
苯酚
细胞学
快速提取不同组织的总RNA
主要成分
TRIzol
TRIZOL的主要成分是苯酚。苯酚的主要作用是裂解细胞,使细胞中的蛋白,核酸 物质解聚得到释放。苯酚虽可有效地变性蛋白质,但不能完全抑制RNA酶活性,因此TRIzol中还加入了8-羟基喹啉、异硫氰酸胍、β-巯基乙醇等来抑制内源和外源RNase(RNA酶)。TRIZOL是从细胞和组织中提取总RNA的即用型试剂,在样品裂解或匀浆过程中,TRIZOL能保持RNA完整性。加入氯仿后,溶液分为水相和有机相,RNA在水相中。取出水相,用异丙醇可沉淀回收RNA。
※0.1%的8-羟基喹啉可以抑制RNase,与氯仿联合使用可增强抑制作用。
※异硫氰酸胍属于解偶剂,是一类强力的蛋白质变性剂,可溶解蛋白质并使蛋白质二级结构消失,导致细胞结构降解,核蛋白迅速与核酸分离。
※β-巯基乙醇的主要作用是破坏RNase蛋白质中的二硫键。
基本特点
Trizol试剂
Trizol试剂可以快速提取人、动物、植物、细菌不同组织的总RNA,该方法对少量的组织(50-100 mg)和细胞(5×106)以及大量的组织(≥1 g)和细胞(>107)均有较好的分离效果。TRIZOL试剂操作上的简单性允许同时处理多个的样品。所有的操作可以在一小时内完成。TRIZOL抽提的总RNA能够避免DNA和蛋白的污染。故而能够作RNA 印迹分析、斑点杂交、poly(A)+ 选择、体外翻译、RNA酶保护分析和分子克隆。并且利用DNA、RNA和蛋白质在不同溶液中的溶解性质,可以通过分层分别将不同层中的RNA(上层)、DNA(中层)、蛋白质(下层)分离纯化出来,效率极好。Trizol试剂能促进不同种属不同分子量大小的多种RNA的析出。例如,从大鼠肝脏抽提的RNA琼脂糖凝胶电泳并用溴化乙啶染色,可见许多介于7 kb和15 kb之间不连续的高分子量条带,(mRNA和hnRNA成分)两条优势核糖体RNA条带位于~5 kb (28S)和~2 kb (18S),低分子量RNA介于0.1 和 0.3 kb之间 (tRNA,5S)。当抽提的RNA用TE稀释时其A260/A280比值≥1.8
使用方法
该法从细胞中提取RNA——用匀浆器将组织磨碎,加入TRIzol处理组织。5分钟后加入氯仿,以每分钟12000转离心5分钟,样品即分成水样层、中间层和有机层。
※RNA存在于水样层中,收集水样层后可以通过异丙醇沉淀RNA来还原。
※在除去水样层后,中间层中的DNA和蛋白质也能相继以沉淀的方式还原:乙醇能使中间层的DNA沉淀析出,在中间层中加入异丙醇能沉淀出蛋白质。
每100ml TRIzol可以抽提100个六孔板中的样品或100个50-80mg的组织样品。无论样品是人、动物、植物还是细菌组织,该方法对少量的组织(50-100mg)和细胞(约五百万个)及大量的组织(≥1g)和细胞(超过一千万个)均有较好的分离效果。
每一百万细胞用TRIzol抽提可得5-15微克RNA,每毫克组织用TRIzol抽提可得1-10微克RNA(产量因细胞和组织不同而异)。
TRIzol操作上的简便性允许其同时处理多个样品,所有的操作可以在一小时内完成。
TRIzol抽提的总RNA能够避免DNA和蛋白质的污染,故而能够作RNA 印迹分析、斑点杂交、poly(A)+ 选择、体外翻译、RNA酶保护分析和单分子克隆(PCR)。
※如果是用于PCR,当两条引物位于单一外显子内时,建议用级联扩大的DNase I(Cat. No. 18068)来处理抽提的总RNA。
※TRIzol试剂能促进不同种属、不同分子量大小的多种RNA的析出。例如,从大鼠肝脏抽提的RNA经过琼脂糖凝胶电泳并用溴化乙啶染色,可见许多介于7kb和15kb之间的不连续的高分子量条带(mRNA和hnRNA成分),两条优势核糖体RNA条带位于~5 kb (28S)和~2 kb (18S),低分子量RNA介于0.1和0.3kb之间 (tRNA,5S)。当抽提的RNA用TE稀释时,其A260/A280比值≥1.8。抽提小RNA时宜-70℃沉淀过夜。
TRIzol对人体有害,使用时应戴一次性手套,注意防止溅出。
⒈样品的制备 当样品富含蛋白质,脂肪,多糖或是细胞外物质例如肌肉,脂肪组织和植物的块茎部分时可能需要一额外的分离步骤。匀浆化后在2—8°C的条件下以12,000×g的离心力离心10分钟,移除匀浆中不溶解的物质,余下的沉淀中包含有细胞外膜,多糖,以及高分子量DNA,而上层的超浮游物含有RNA。在来自于脂肪组织的样品中,大量的脂肪漂在最上层因而应该除掉。在每一个个案中,将清亮的匀浆溶液转移到一干净的试管中加入氯仿并继续进行下述的分离步骤。
⒉ 分离阶段 将匀浆样品在15—30°C条件下孵育5分钟以使核蛋白体完全分解。每1 ml TRIZOL加0.2 ml氯仿。盖紧样品管盖,用手用力摇晃试管15秒并将其在30°C下孵育2—3分钟。在2—8°C下以不超过12,000×g的离心力高速冷冻离心15分钟。离心后混合物分成三层:下层红色的苯酚-氯仿层,中间层,上层无色的水样层。RNA无一例外地存在于水样层当中。水样层的容量大约为所加TRIZOL容量的60%。
⒊ RNA的沉淀 将水样层转移到一干净的试管中,如果希望分离DNA和蛋白,有机层同样要予以保留。通过将水样层和异丙醇混合来沉淀RNA。最初均化时的每1 ml TRIZOL对应0.5 ml异丙醇。将混合的样品在15—30°C条件下孵育10分钟并在2—8°C下以不超过12,000×g的离心力高速冷冻离心10分钟。RNA沉淀在离心前通常不可见,形成一胶状片状沉淀附着于试管壁和管底。
4 .RNA的洗脱 移去上层悬液。用75%的乙醇洗涤RNA沉淀一次,每1 ml的 TRIZOL至少加1 ml的75%乙醇。旋涡振荡混合样品并在2—8°C下以不超过7,500×g的离心力高速冷冻离心5分钟。
⒌ RNA的再溶解 在操作的最后,简单干燥RNA沉淀(空气干燥或真空干燥5—10分钟)不要在真空管里离心干燥RNA。尤为重要的是,不能让RNA沉淀完全干燥那样会极大地降低它的可溶性。部分溶解的RNA样品其A260/280比值< 1.6。用移液管尖分几次移取无RNA酶的水或0.5% SDS溶液来溶解RNA,并在55—60°C下孵育10分钟(当RNA以后要用于酶切反应时,避免使用SDS。)RNA还能被100%甲酰胺(除去离子)再溶解并保存在–70°C。
RNA抽提注意事项
⒈从少量的组织(1—10 mg)或细胞(102—104)中分离RNA 样品:往组织或细胞中加入800 µl TRIZOL。待样品裂解后,加入氯仿并进行步骤2中的抽提操作。在用异丙醇沉淀RNA之前,加入5—10μg无RNA酶的脂质体(CatNo 10814)作为水样层的载体。为降低其黏度在加入氯仿前用26号注射器抽吸两次以切断基因组DNA。脂质体会留在水样层中并和RNA共析出。在浓缩到4 mg/ml之前它不会抑制第一丝状体的合成也不会抑制PCR。
⒉在匀化后和加入氯仿之前,样品可以在–60—–70°C保存至少一个月。RNA沉淀(步骤4,RNA洗脱)溶于75%的乙醇在2—8°C至少可以保存一周,在–5—–20°C下至少可保存一年。
⒊台式离心机最大能达到2,600×g的离心力,如果将离心时间延长到30-60分钟可以满足步骤2和步骤3中的操作。
配制方法
在2000ml的烧杯中加入以下物质,混合均匀:
500ml重蒸苯酚;
250g异硫氰酸胍;
293mL蒸馏水;
⒘6mL 0.75M 柠檬酸钠溶液(pH≥7)
26.4mL 10%sarcosy(十二烷基肌氨酸钠)溶液
50mL 2M NaAc溶液(pH≥4)
TRIzol需4℃低温保存,保质期约一年。100mL TRIzol试剂市场售价约478元人民币。
注释:⑴水和苯酚部分互溶,Trizol中苯酚被水饱和,形成均匀溶液;⑵NaAc等盐类的作用是提供缓冲环境。
选择
互溶,Trizol中苯酚被水饱和,形成均匀溶液;⑵