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浙江大学微分析系统研究所由我国著名分析化学家方肇伦院士创建于2000年初，目标是发展具有中国特色的微流控芯片（Microfluidic chip）分析技术和系统。微流控芯片分析是当前的科技前沿领域之一，其目标是通过对芯片微通道网络内微流体的操纵和控制，完成化学实验室中取样、预处理、反应、分离和检测等分析功能，实现分析装备的微型化、集成化和自动化，最终实现芯片化－即所谓"芯片实验室"（Lab-on-a-chip）。研究所现有教授5名（其中国家杰出青年科学基金获得者1人、教育部跨世纪人才计划获得者 1 人），副教授5名，实验技术人员1名，博士和硕士研究生40余名。研究所每年在化学一级学科和分析化学二级学科招收博士和硕士研究生10余名，并接受博士后人员和访问学者，同时欢迎生物、医学、药学、生物医学工程、光学、电子学、流体力学等相关专业的同学报考研究生。

研究所研究方向涉及微纳流控芯片加工和表面处理技术和工艺，微流体操控技术、方法和理论，微流控芯片取样、试样引入和前处理、反应技术，和微流控芯片光学、电化学、质谱检测技术研究；基于微流控原理的液滴分析、毛细管电泳、流动注射分析、生物传感器分析系统研究，以及纳米技术和仿生技术在微流控系统中的应用；基于微流控技术的微型化分析仪器研制；微流控系统在生物分离、单细胞分析、蛋白质组研究、临床检验、高通量筛选中的应用等多个领域。

研究所成立近十年来，在全所师生的共同努力下，取得了可喜的成绩，探索出了一条有中国特色的微流控分析自主研发之路，在微流控芯片简易加工技术，微流控试样引入技术、微流控单细胞分析、微流控荧光和光度检测系统的微型化等方面，取得了具有国际先进水平的研究成果。共承担和参与省部级以上项目50余项，其中主持国家自然科学基金重大项目1项，主持国家杰出青年基金项目1 项，主持国家自然科学基金面上项目11 项，主持国家科技部863项目课题1项，973项目课题1项，主持省部级科研项目10余项。发表SCI论文140余篇。申请国家发明专利40余项，其中20余项已获授权。还研制了多种具有自主知识产权的微流控分析仪器装置或样机，为相关仪器的产业化创造了有利基础。