蛋白质多态性(protein polymorphism)指一种蛋白质存在多种不同的变型，这些变型的产生是由于同一基因位点内的突变，产生复等位基因，导致合成不同类型的蛋白质，人类蛋白质的多态性往往和人种及其地理分布有关。在目前已发现的近20种载脂蛋白中，ApoAⅠ、AⅡ、AⅣ、CⅡ、CⅢ、E及Apo(a)等存在明显的多态性，这些载脂蛋白可以以分子大小/电荷互不相同的多种形式存在。彼此互称异构体(isoform)。多态性反映了载脂蛋白结构的不均一性。